9月9日，上海市重大建设工程办公室在市政府会议室召开会议，专题协调钱学森图书馆基建工程出土工作。会议明确，钱学森图书馆基建工作必须按照市领导的要求及时完成，请市区各相关单位继续支持。会议要求上海交大钱馆建设指挥部应继续加强现场协调，确保出土和深基坑开挖工作安全、顺利进行。工程建设单位也应合理组织，进一步做好现场管理和文明施工，尽量减小对周边环境的影响。
根据此次会议精神，钱馆基建工作在完成桩基工程的基础上，目前已转入基础施工阶段，包括基坑土方开挖和基础底板施工等。9月29日，钱馆建设指挥部、监理公司和总承包单位对施工现场进行了安全检查，大家在肯定成绩的基础上要求施工单位对存在的安全隐患进一步进行整改。九月底，华南理工大学建设设计院何镜堂院士来校进行了钱馆外墙立面石材的遴选，并初步确定了花岗岩的品种。